中國健康教育中心的前身“中國健康教育研究所”成立于1986年。2001年12月，更名為中國疾病預防控制中心健康教育所。2008年9月更名為中國健康教育中心（衛(wèi)生部新聞宣傳中心），直屬衛(wèi)生部管理；2013年3月，直屬國家衛(wèi)生計生委管理。

中國健康教育中心是中國衛(wèi)生和計劃生育委員會直屬事業(yè)單位，負責全國健康教育與衛(wèi)生計生新聞宣傳工作的技術(shù)指導，開展相關理論與實踐的研究，承擔全國健康教育與衛(wèi)生計生新聞宣傳大型活動的組織實施及信息管理、媒體聯(lián)系、業(yè)務培訓等有關技術(shù)和服務性工作。