京九線經(jīng)過的城市有：北京、商丘、南昌、深圳、香港。

具體經(jīng)過的地區(qū)為：北京。河北的固安、霸州、文安、 任丘、肅寧、饒陽、深州﹑衡水、棗強(qiáng)、清河城。山東的臨清、聊城、陽谷、梁山、鄆城、鄄城、菏澤、定陶、曹縣。河南的臺前、商丘、淮濱、潢川、新縣。安徽的亳州、阜陽。湖北的麻城、黃州、浠水、蘄春、武穴。

江西的九江、德安、共青城、永修、南昌、豐城、樟樹、新干、峽江 、吉安、泰和、興國、贛州、信豐、龍南、定南。廣東的和平、龍川、河源、惠州、東莞、深圳。

香港的新界京九鐵路連接北京——香港九龍，途經(jīng)京、冀、魯、豫、皖、鄂、贛、粵9省市和香港特別行政區(qū)，是一條南北干線，對于緩解南北鐵路運(yùn)輸?shù)木o張狀況起重要作用。京九鐵路沿線穿行地區(qū)有平原和丘陵，尤其是南段幾乎全部在江南丘陵和兩廣丘陵中穿行，這給鐵路施工帶來了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，除此之外在大別山區(qū)還繞開了崎嶇地形，促進(jìn)老區(qū)經(jīng)濟(jì)的同時(shí)，減小了工程難度。、九龍。