深圳書城南山店一共有五層，一層是公共休閑場所，書城會組織一些親子活動，讀書活動，然后在一樓有一些商店。

二樓到四樓是書城的售書樓層，二樓售買中醫(yī)、計算機、建筑等書籍。三樓售賣文學、哲學、法律等書籍;四樓售賣教育、少兒、外語等書籍。

五樓是弘文藝術公司以及書城的培訓機構。