木薯粉和紅薯粉的不同之處為原料、黏性、透明度、凝膠性、顆粒度等。

原料不同，木薯粉的原料是木薯，紅薯粉的原料是番薯，木薯和番薯是兩種不同的植物；黏性不同，木薯粉的黏性要優(yōu)于紅薯粉；糊化后的通明度不同，木薯粉糊化后的透明度高于紅薯粉；凝膠性不同，紅薯粉的凝膠性要強于木薯粉；分子顆粒度大小不同，紅薯淀粉顆粒大禹木薯淀粉。

二者的特性各不相同，使用方法也不一樣，紅薯粉主要是用于制作事物，常被加工成粉絲、粉皮等食物，口感順滑有韌性；木薯粉最常見的用法是作為珍珠奶茶的珍珠，此外就是作為工業(yè)淀粉的原料。